Dertig jaar nadat de eerste koloniale schepen vanuit Ganymedes waren gestuurd, besloot de mensheid Project Galileo te lanceren! Het doel: de vier belangrijkste satellieten van Jupiter (Io, Europa, Ganymedes en Callisto) vestigen om de menselijke aanwezigheid in het zonnestelsel te verbreden. Dit project is genoemd naar de Italiaanse intellectueel Galileo, die in 1610 als eerste deze vier satellieten aan de hemel waarnam.

In Galileo Project speel je als dezelfde bedrijven die betrokken zijn bij de gebeurtenissen van Ganymedes en regel je de vier satellieten van Jupiter door robots van de aarde en Mars te kopen, experts te rekruteren, technologieën te ontwikkelen en superstructuren te bouwen.

Galileo Project is een op zichzelf staand spel in het Ganymede-universum, dat combo's en het bouwen van motoren combineert.